異次元空間『影之世界』持續侵蝕世界。人類不得不面對影世界帶來的最可怕的災難『影子迷宮』。「戴基爾·阿曼德」與同伴一同對抗最後一個『影子迷宮』的最終頭目破滅龍（波羅米歐·納波利坦），卻仍迎來世界的滅亡結局。就在戴基爾萬念俱灰的瞬間眼前出現了熟悉的光景……竟是13年前的世界。戴基爾竟回到了他的母校，全帝國第一的魔法學園「赫布里溫學院」的開學典禮上。於是他為了拯救世界，再次集結伙伴們，起身反抗終將到來的滅亡命運！